239 180 hipotez gatunkowych grzybów w bazie UNITE

UNITE to prowadzona przez Uniwersytet w Tartu baza sekwencji regionu ITS, wykorzystywanego jako kod kreskowy grzybów. W wersji 10.0, zaktualizowanej 25 marca 2026 roku, baza zawiera 3 846 536 sekwencji ITS pochodzących z UNITE i międzynarodowych baz nukleotydowych oraz 239 180 grzybowych hipotez gatunkowych wyznaczonych przy progu 1,0 procent różnicy.

Hipoteza gatunkowa nie jest gatunkiem w sensie nomenklatorycznym. To grupa sekwencji na tyle do siebie podobnych, że traktuje się je jako jedną jednostkę operacyjną, oznaczoną własnym kodem i identyfikatorem DOI. Klastry wyznacza się na kilku progach — od 0,5 do 3,0 procent — więc liczba jednostek zależy od wybranego progu. Podana wartość dotyczy progu jednoprocentowego i bez tej informacji jest nieporównywalna.

Zestawienie z liczbą gatunków opisanych formalnie jest tu najciekawsze. Rejestry nomenklatoryczne notują ponad 150 tysięcy nazw grzybów, a UNITE — o kilkadziesiąt tysięcy jednostek więcej, przy czym większość z nich nie ma nazwy naukowej i pochodzi z sekwencji środowiskowych: z gleby, wody, powietrza czy tkanek innych organizmów. Znaczna część różnorodności grzybów jest więc znana jako sekwencja, zanim ktokolwiek zobaczy owocnik.

Liczba jest migawką konkretnego wydania i zmienia się z każdą kolejną wersją, gdy przybywa sekwencji i przeliczane są klastry. Każde wcześniejsze wydanie zostaje jednak zachowane, a kod hipotezy zawiera numer wersji, dzięki czemu oznaczenie sprzed lat da się odtworzyć. To rzadka i cenna cecha: baza rośnie, nie unieważniając przy tym własnej historii.

Klaster sekwencji nie jest formalnie opisanym gatunkiem

Wersja 10.0 UNITE z 25 marca 2026 r. zawierała 3 846 536 sekwencji ITS i 239 180 grzybowych hipotez gatunkowych przy progu 1% różnicy między klastrami. Hipoteza gatunkowa, oznaczana stabilnym identyfikatorem SH, grupuje sekwencje do analiz ekologicznych i porównywania zbiorów. Może odpowiadać opisanemu gatunkowi, kilku bliskim gatunkom albo linii bez formalnej nazwy.

Próg jest częścią wyniku: przy innym poziomie podobieństwa liczba klastrów się zmieni. Nie wolno więc odejmować 155 tys. nazw od 239 180 hipotez i nazywać różnicy liczbą „nowych gatunków”. To dwa systemy porządkowania innych rodzajów dowodu.